Note 문서 데이터베이스가 스키마리스 데이터베이스인데도 문서 데이터베이스의 일부 요소는 관계형 데이터베이스의 스키마와 유사한 것이 있다. 인덱스가 그 중 하나다. 인덱스는 관계형 데이터베이스에서 물리적인 데이터 모델의 일부로, 엄연히 하나의 데이터 구조다. 또한 스키마의 일부분이다. 문서 데이터베이스 같은 스키마리스 데이터베이스도 인덱스와 비슷한 객체가 있다. 문서 데이터베이스에서 읽기 작업의 속도를 향상시킬 수 있고 샤딩을 구현할 때도 유용하게 쓰인다. 한 컬렉션에 있는 모든 문서는 하나의 샤드 속에 들어가야 하므로 모든 문서에 샤드 키가 있다는 것은 중요한 사실이다.