스프링 프레임워크 버전 3.0에서는 스프링 컨테이너를 설정하는 새로운 방법인 자바 빈 설정 클래스_{Java bean configuration class}를 도입했다. 처음에는 별도의 프로젝트로 시작했지만 스프링 프레임워크 팀이 버전 3.0에서 코어 모듈로 포함했다. 클래스들 사이의 관계와 상호 작용 방법에 대한 명료한 그림을 얻고, 경우에 따라서는 XML 파일을 사용할 때 오는 혼란을 피하는 데 도움을 주기 때문에 요즘은 가장 선호하는 컨테이너 설정 방법이다.